Craig Venter

生命はDNAソフトウェアシステムである。

John Craig Venterはアメリカの生物工学者であり実業家である。彼はヒトゲノムの初の草案配列を主導し、合成染色体で細胞をトランスフェクトした最初のチームを組織したことで知られている。Venterはセレラ・ジェノミクス、ゲノム研究所TIGR、およびJ. Craig Venter Institute JCVIを設立し、現在はCEOを務めている。彼はHuman Longevity Inc.およびSynthetic Genomicsの共同設立者であった。彼はTime誌の2007年および2008年のTime 100リストで世界で最も影響力のある人物として掲載された。2010年には、イギリスの雑誌New Statesman「The World's 50 Most Influential Figures 2010」リストで14位にCraig Venterをリストアップした。2012年、Venterはゲノム研究への貢献に対してDan David賞で表彰された。彼はUSA Science and Engineering Festival's Advisory Boardのメンバーである。

初期の人生と教育

Venterはユタ州Salt Lake Cityで、ElizabethとJohn Venterの息子として生まれた。若い頃、彼は教育を真摯に受け止めず、ボートやサーフィンで水の上での時間を過ごすことを好んでいた。彼の伝記「A Life Decoded」によると、彼は熱心な学生ではないと言われており、8年生のレポートカードではCsとDsを持っていた。彼はカリフォルニア州Millbraeのmills High Schoolを卒業した。

ベトナム戦争に反対していたにもかかわらず、Venterは徴兵され、アメリカ海軍に入隊し、野戦病院の集中治療病棟で働いた。ベトナムにいる間、彼は海に泳ぎ出して自殺を試みたが、1マイル以上沖で気が変わった。重傷を負った瀕死の海兵隊員に毎日直面することで、医学を研究したいという欲求が彼に生じたが、その後彼は生物医学研究に転向した。

VenterはカリフォルニアのCollege of San Mateóのコミュニティカレッジで大学教育を開始し、その後カリフォルニア大学サンディエゴ校に転編入し、生化学者Nathan O. Kaplanの下で研究した。彼は1972年に生化学の学士号を、1975年にUCSDから生理学と薬理学の博士号を取得した。

職業

ニューヨーク州立大学バッファロー校の准教授その後教授として働いた後、彼は1984年に国立衛生研究所に入職した。

EST論争

NIHの職員中、VenterはmRNAを識別する方法を学び、ヒト脳で発現しているものについてさらに学び始めた。彼が関心を持っていた短いcDNA配列フラグメントは、expressed sequence tagsまたはEST と呼ばれている。NIH Office of Technology TransferとVenterは、他の人によって発見されたESTを獲得し、ヒト脳でのmRNA発現の研究に基づいて同定された遺伝子の特許を取得しようと決定した。Venterが議会公聴会でこの戦略を開示したとき、論争の嵐が発生した。その後、NIHは取り組みを中止し、公の抗議に続いて提出した特許出願を放棄した。

ヒトゲノムプロジェクト

Venterはゲノミクスの力がヘルスケアを根本的に変える可能性について情熱を持っていた。Venterはショットガンシーケンシングが有用なヒトゲノムデータを得るための最速かつ最も効果的な方法だと信じていた。しかし、この方法はヒトゲノムプロジェクトによって拒否された。というのは、一部の遺伝学者はそれが人間のような複雑なゲノムには正確ではないだろう、物流的により困難になるだろう、そしてはるかに多くの費用がかかるだろうと感じたからである。

Venterはヒトゲノムプロジェクトでの進歩の遅い進度を、遺伝子を特許取得することへの興味を続ける機会と見なし、Celera Genomicsを開始するために民間部門から資金調達を求めた。同社は、ユーザーが手数料でサブスクライブできるゲノムデータを作成することで、彼らの仕事から利益を得る予定だった。その結果、目標は公共ゲノムプログラムに圧力をかけ、いくつかのグループが完全な配列を生成する努力を倍増させました。Venterの努力は、彼とCelera Corporationのチームが、公的資金によるヒトゲノムプロジェクトと共に最初の草案ヒトゲノムを配列決定するための名声を獲得しました。

2000年、国立衛生研究所のVenterとFrancis Collins および米国公開ゲノムプロジェクトは、ヒトゲノムのマッピングの発表を共同で行いました。これは、公開ゲノムプログラムの予想終了より3年早くでした。発表は米国大統領Bill Clintonおよび英国首相Tony Blairと共に行われました。VenterとCollinsはA&E Networkから「Biography of the Year」の賞を共有した。2001年2月15日、ヒトゲノムプロジェクトコンソーシアムは、最初のヒトゲノムを雑誌Natureで発表し、その翌日にCeleraがScienceで発表した。ショットガンシーケンシングが、ヒトゲノムプロジェクトによって選ばれたクローンバイクローン法よりもいくつかの方法で正確性が低いという主張があったにもかかわらず、この技術は科学コミュニティによって広く受け入れられるようになりました。

Venterは2002年初めにCeleraによって解雇されました。彼の伝記によると、Venterは主要投資家Tony Whiteとの葛藤のため、特にヒトゲノムの配列決定の成果を祝うホワイトハウスセレモニーへの出席が禁止されたため、解雇されました。

グローバルオーシャンサンプリング遠征

グローバルオーシャンサンプリング遠征GOSは、海洋微生物コミュニティの遺伝的多様性を評価し、自然の基本的なプロセスにおけるそれらの役割を理解することを目的とした海洋探査ゲノムプロジェクトである。2003年8月にSargasso Sea試験サンプリングプロジェクトとして開始されたVenterは、2004年3月4日に完全な遠征を発表しました。Venterの個人的なヨット、Sorcerer IIを使用したこのプロジェクトはカナダのHalifaxで始まり、地球を一周して2006年1月に米国に戻りました。

合成ゲノミクス

2005年6月、Venterは合成ゲノミクスの共同設立者となりました。修正された微生物を使用してクリーンな燃料と生化学物質を生成することに専念する企業です。2009年7月、ExxonMobilはSynthetic Genomicsと次世代バイオ燃料の研究開発に600百万ドルのコラボレーションを発表しました。Venterは、バイオ燃料の生産のために設計された珪藻マイクロアルガエの作成に取り組み続けています。

Venterは、最初の部分的に合成種を特許取得しようとしており、おそらくMycoplasma laboratoriumと呼ばれるでしょう。この研究路線は、特定の反応を実行するように設計されたバクテリアを生成することにつながる可能性があるという推測があります。例えば、燃料を生成し、医学を製造し、地球温暖化に対抗します。

2010年5月、Venterが率いる科学者チームは、「合成生物」と記載されたものを正常に作成した最初のチームになりました。これは、バクテリウムゲノム全体を含む非常に長いDNA分子を合成し、これを別の細胞に導入することで行われました。これはEckard Wimmerのグループの成功と同様で、RNAウイルスゲノムを合成および結紮し、細胞溶解液で「ブート」させました。単一細胞生物は、合成として識別し、その子孫を追跡するためにDNAに書き込まれた4つの「透かし」を含んでいます。透かしには以下が含まれます

1. 句読点付きの全アルファベットのコードテーブル
2. 46人の貢献科学者の名前
3. 3つの引用
4. 細胞のための秘密のメールアドレス。

2016年3月25日、Venterはsyn 3.0の作成を報告しました。これは、自由に生きているどの有機体よりも473遺伝子の最も遺伝子を持つ合成ゲノムである。彼らの目標は、非本質的なすべての遺伝子を取り除き、生命を支援するために必要な最小限の集合のみを残すことでした。このストリップダウンされた高速繁殖細胞は、この分野の研究者にとって貴重なツールになると予想されます。

2018年8月、Venterは取締役会会長を引退し、J. Craig Venter研究所での彼の仕事に焦点を当てたいと述べました。彼は引き続き取締役会の科学顧問として留まります。

J. Craig Venter Institute

Venterは現在、合成生物学の研究を実施する非営利団体であるJ. Craig Venter Instituteの最高経営責任者です。Venterは2006年に組織を設立しました。La JollaとメリーランドのRockvilleに施設があり、200人以上を雇用しています。

個別のヒトゲノム

2007年9月4日、Sam Levyが率いるチームは、個別のヒト(Venter自身のDNA配列)の最初のゲノムの1つを発表しました。Venterゲノムのいくつかの配列は、湿ったイヤーワックス、反社会的行動のリスク増加、アルツハイマー病および心血管疾患に関連しています。この出版は特に興味深かったのは、2つのハプロタイプ(各染色体の2つのコピー)を分離しようとしたためですが、限定的な方法でのみこれを達成しました。公開されたゲノムは、完全にジプロイド配列を構成する完全な6億塩基ではなく、30億塩基のみを持っていました。最初のハプロタイプ解像度のあるヒトゲノムが現れ始める前に、さらに10年が経過しました。

ヒトリファレンスゲノムブラウザは、Venterの最近発表されたゲノムのナビゲーションと分析のためのWebアプリケーションです。HuRefデータベースは、microfluidic Sangerシーケンシングを使用してシーケンスされた約3200万のDNA読み取りで構成され、4,528スキャフォールドに組み立てられ、ゲノム分析によって同定された410万のDNA変動があります。これらの変異には、一塩基多型SNP、ブロック置換、短および大規模な挿入欠失、および挿入、欠失、反転、およびコピー数変化などの構造的変動が含まれます。

ブラウザにより、科学者はHuRefゲノムアセンブリおよび配列変動をナビゲートし、NCBI和36アセンブリとNCBIおよびEnsembl注釈のコンテキストで比較することができます。ブラウザは、NCBIとHuRefコンセンサス配列間の比較ビュー、HuRefアセンブリのシーケンスマルチアライメント、EnsemblおよびdbSNP注釈、HuRef変異、および基礎となる変異証拠および機能分析を提供します。インターフェースはまた、二倍体ゲノム配列を推定でき、遺伝子注釈への変異の関係を表すハプロタイプブロックを表します。変異と遺伝子注釈の表示は、dbSNP、Ensembl、Online Mendelian Inheritance in Man OMIM、およびGene Ontology GOを含む外部の公開リソースにリンクされています。

ユーザーはHUGO遺伝子名、EnsemblおよびdbSNP識別子、HuRefコンティグまたはスキャフォールドロケーション、またはNCBI染色体ロケーションを使用してHuRefゲノムを検索できます。その後、ユーザーは簡単かつ直感的なパンおよびズームコントロール経由でゲノム領域を簡単にすばやくブラウズできます。さらに、特定の遺伝子座に関連するデータは、さらなる分析のためにエクスポートできます。

Human Longevity、Inc。

2014年3月4日、Venterおよび共同設立者Peter DiamandisおよびRobert Hariiriは、健康的な「高性能」ヒトの寿命を延ばすことに焦点を当てた企業であるHuman Longevity、Inc.の形成を発表しました。発表時に、同社は既に7,000万ドルのベンチャーファイナンスを集めており、これは18ヶ月続くと予想されました。Venterは2018年5月まで会長兼最高経営責任者CEOを務め、その時に引退しました。同社は年間40,000のゲノムを配列決定する計画があると述べており、最初は癌ゲノムと癌患者のゲノムに焦点を当てています。

Human Longevityは2018年にVenterに対して訴訟を提起し、営業秘密を盗んだと非難しました。Venterが競合事業を開始するために使用できる貴重な情報を含む会社のコンピュータで出発したと述べる主張がなされました。訴訟は最終的にカリフォルニア判事によって却下されました。その根拠は、Human Longevityが、企業または個人が営業秘密を盗んだときに訴訟を起こすために必要な法的基準を満たす事件を提示できなかったためです。

Human Longevityのミッションは、ゲノミクス、メタボロミクス、マイクロバイオミクス、およびプロテオミクスからの高解像度ビッグデータ診断と幹細胞療法の使用によって健康的なヒトの寿命を延ばすことです。

出版された本

Venterは2冊の著者です。最初は「A Life Decoded」というタイトルの自伝です。Venterの2番目の本は「Life at the Speed of Light」というタイトルで、これはコンピュータプログラミングとDNAシーケンシングによる生命の遺伝子プログラミングで表される以前の2つの異なる科学分野が織り交ぜられている世代であるという彼の理論を発表しました。彼は未来派のRay Kurzweilによってこの立場について拍手喝采を受けました。

私生活

Barbara Rae-Venterとの短い結婚の後、彼女と一緒に息子Christopherがいて、彼はClaire M. Fraserと結婚し、2005年まで彼女と結婚したままでした。2008年後半、彼はHeather Kowalskiと結婚しました。彼らはカリフォルニア州サンディエゴのLa Jollaの近所に住んでいます。Venterは無神論者です。

Venterは、青年期での彼の行動が、注意欠陥多動性障害ADHDを示しており、その後彼自身のDNAでADHDに関連する遺伝的変異体を見つけたと考えました。

ポップカルチャーで

Venterは、Wired、The Economist、オーストラリア科学雑誌Cosmos、およびThe Atlanticを含むいくつかの雑誌の記事の対象でした。

Venterは2001年の2時間のNOVAスペシャル「Cracking the code of life」に登場しています。

2004年5月16日、Venterはボストン大学でのコメンスメントスピーチを行いました。

2007年12月4日、VenterはロンドンのBBCのDimbleby講演を行いました。

Venterは、アルバータ大学の科学部門の栄誉と専門化学生のための2008年の招集スピーチを発表しました