Craig Venter

생명은 DNA 소프트웨어 시스템이다.

John Craig Venter는 미국의 생명공학자이자 사업가이다. 그는 인간 게놈의 첫 번째 초안 수열 작업을 주도한 것으로 알려져 있으며 합성 염색체로 세포를 형질전환한 첫 번째 팀을 구성했다. Venter는 Celera Genomics, The Institute for Genomic Research TIGR, 그리고 J. Craig Venter Institute JCVI를 설립했으며, 현재 최고경영자로 재직 중이다. 그는 Human Longevity Inc.와 Synthetic Genomics의 공동 설립자였다. 그는 2007년과 2008년 Time 100 목록에 세계에서 가장 영향력 있는 인물로 올랐다. 2010년 영국 잡지 New Statesman은 Craig Venter를 "2010년 세계 50대 영향력 있는 인물"의 14위에 선정했다. 2012년 Venter는 게놈 연구에 대한 기여로 Dan David Prize로 영예를 받았다. 그는 USA Science and Engineering Festival의 자문위원회 위원이다.

초기 삶과 교육

Venter는 Utah의 Salt Lake City에서 Elizabeth와 John Venter의 아들로 태어났다. 어린 시절 그는 교육을 진지하게 여기지 않았으며, 대신 보트나 서핑으로 물 위에서 시간을 보내기를 선호했다. 그의 전기 A Life Decoded에 따르면, 그는 끔찍하게 열심히 하지 않은 학생이었으며, 8학년 성적표에 C와 D를 받았다고 한다. 그는 California의 Millbrae에 있는 Mills High School을 졸업했다.

베트남 전쟁에 반대했지만, Venter는 징집되어 미합중국 해군에 입대했으며 야전 병원의 중환자실에서 근무했다. 베트남에 있는 동안 그는 바다로 헤엄쳐 나가 자살을 시도했지만, 1마일 이상 떨어진 곳에서 마음을 바꿨다. 심각한 부상과 죽어가는 해병들을 매일 맞닥뜨린 것이 의학을 공부하고자 하는 열망을 심어주었지만, 나중에 생의학 연구로 전환했다.

Venter는 California의 College of San Mateo에서 대학 교육을 시작했으며, 나중에 University of California, San Diego로 전학했으며, 생화학자 Nathan O. Kaplan 아래에서 공부했다. 그는 1972년 생화학 학사 학위와 UCSD에서 1975년 생리학 및 약리학 박사 학위를 받았다.

경력

State University of New York at Buffalo에서 부교수, 나중에 정교수로 근무한 후, 그는 1984년 National Institutes of Health에 입사했다.

EST 논쟁

NIH의 직원으로 일하던 중 Venter는 mRNA를 식별하는 방법을 배웠고 인간의 뇌에서 발현되는 것에 대해 더 배우기 시작했다. 그가 관심을 가진 짧은 cDNA 수열 단편들은 expressed sequence tags 또는 EST라고 불린다. NIH Office of Technology Transfer와 Venter는 다른 사람들이 발견한 EST를 취하여 인간 뇌의 mRNA 발현 연구를 기반으로 식별된 유전자를 특허하려고 시도했다. Venter가 의회 청문회에서 이 전략을 공개했을 때, 큰 논쟁이 일어났다. NIH는 나중에 이 노력을 중단하고 공개 반발 이후 제출한 특허 출원을 포기했다.

인간 게놈 프로젝트

Venter는 게놈학의 의료 혁신 능력에 열정적이었다. Venter는 샷건 수열법이 유용한 인간 게놈 데이터를 얻는 가장 빠르고 효과적인 방법이라고 믿었다. 그러나 이 방법은 Human Genome Project에 의해 거부되었는데, 일부 유전학자들은 인간만큼 복잡한 게놈에는 정확하지 않을 것이고, 물류적으로 더 어려울 것이며, 비용이 훨씬 더 들 것이라고 생각했기 때문이다.

Venter는 Human Genome Project의 느린 진행 속도를 유전자 특허에 대한 관심을 계속할 수 있는 기회로 봤으므로, 민간 부문으로부터 자금을 구해 Celera Genomics를 시작했다. 이 회사는 사용자가 수수료를 내고 구독할 수 있는 게놈 데이터를 만들어서 자신의 일에서 이익을 얻을 계획이었다. 따라서 이 목표는 공개 게놈 프로그램에 압력을 가했고 여러 그룹이 완전한 수열을 생산하기 위해 노력을 두 배로 늘리도록 자극했다. Venter의 노력은 그와 Celera Corporation의 팀이 공적으로 자금을 받은 Human Genome Project와 함께 첫 번째 초안 인간 게놈 수열화에 대한 공로를 나누면서 명성을 얻었다.

2000년, Venter와 National Institutes of Health의 Francis Collins 그리고 U.S. Public Genome Project는 인간 게놈의 매핑 발표를 공동으로 했으며, 이는 Public Genome Program의 예상 종료 시간보다 3년이나 앞선 것이었다. 발표는 U.S. President Bill Clinton, UK Prime Minister Tony Blair와 함께 이루어졌다. Venter와 Collins는 따라서 A&E Network로부터 "Biography of the Year"에 대한 상을 나누었다. 2001년 2월 15일, Human Genome Project 컨소시엄은 첫 번째 Human Genome을 Nature 저널에 발표했으며, 1일 후 Celera가 Science에 발표했다. 샷건 수열법이 어떤 면에서는 Human Genome Project가 선택한 clone-by-clone 방법보다 정확하지 않다는 일부 주장에도 불구하고, 그 기법은 과학 공동체에 의해 널리 받아들여졌다.

Venter는 2002년 초 Celera에서 해고되었다. 그의 전기에 따르면, Venter는 주요 투자자 Tony White와의 충돌로 해고되었으며, 특히 인간 게놈 수열화 성취를 축하하는 White House 행사 참석을 금지당했다.

Global Ocean Sampling Expedition

Global Ocean Sampling Expedition GOS는 해양 미생물 공동체의 유전적 다양성을 평가하고 자연의 기본 과정에서 그들의 역할을 이해하는 것을 목표로 하는 해양 탐사 게놈 프로젝트이다. 2003년 8월 Sargasso Sea 파일럿 샘플링 프로젝트로 시작되어 Venter는 2004년 3월 4일 전체 Expedition을 발표했다. Venter의 개인 요트 Sorcerer II를 사용한 이 프로젝트는 Halifax, Canada에서 시작하여 지구를 일주하고 2006년 1월 미국으로 돌아왔다.

Synthetic Genomics

2005년 6월, Venter는 Synthetic Genomics를 공동 설립했으며, 이는 변형된 미생물을 사용하여 깨끗한 연료와 생화학 물질을 생산하는 데 전념하는 회사이다. 2009년 7월, ExxonMobil은 다음 세대 바이오 연료를 연구 및 개발하기 위해 Synthetic Genomics와 6억 달러의 협력을 발표했다. Venter는 바이오 연료 생산을 위해 설계된 이원자 미세조류의 창조에 계속 일하고 있다.

Venter는 첫 번째 부분 합성 종을 특허하려고 하며, 아마도 Mycoplasma laboratorium이라는 이름을 붙일 것이다. 이러한 연구 방향이 특정 반응을 수행하도록 설계된 박테리아, 예를 들어 연료를 생산하고, 약을 만들고, 지구 온난화에 대항하는 등을 생산하는 것으로 이어질 수 있다는 추측이 있다.

2010년 5월, Venter가 이끄는 과학자 팀은 "합성 생명"으로 설명된 것을 성공적으로 만든 첫 번째가 되었다. 이는 전체 박테리아 게놈을 포함하는 매우 긴 DNA 분자를 합성하고 이를 다른 세포에 도입함으로써 수행되었으며, 이는 RNA 바이러스 게놈을 합성하고 연결하고 세포 용해액에서 "부트"한 Eckard Wimmer의 그룹의 업적과 유사하다. 단일 세포 생물은 이를 합성으로 식별하고 자손을 추적하는 데 도움이 되도록 DNA에 기록된 4개의 "워터마크"를 포함한다. 워터마크에는

1. 구두점이 있는 전체 알파벳의 코드 테이블
2. 46명의 기여한 과학자의 이름
3. 3개의 인용문
4. 세포의 비밀 이메일 주소.

2016년 3월 25일 Venter는 Syn 3.0의 생성을 보고했으며, 이는 자유롭게 생활하는 모든 생물체 중 가장 적은 유전자 473개를 가진 합성 게놈이다. 그들의 목표는 모든 필수적이지 않은 유전자를 제거하여 생명을 유지하는 데 필요한 최소 집합만 남기는 것이었다. 이 축소된 빠르게 번식하는 세포는 이 분야의 연구자들에게 귀중한 도구가 될 것으로 예상된다.

2018년 8월, Venter는 이사회 회장에서 물러났으며, J. Craig Venter Institute에서의 작업에 집중하고 싶다고 말했다. 그는 이사회의 과학 자문역으로 남을 것이다.

J. Craig Venter Institute

Venter는 현재 J. Craig Venter Institute의 최고경영자이며, 이는 합성 생물학 연구를 수행하는 비영리 단체이다. Venter는 2006년 이 조직을 설립했다. 이 조직은 La Jolla와 Rockville, Maryland의 시설이 있으며 200명 이상을 고용하고 있다.

개인 인간 게놈

2007년 9월 4일, Sam Levy가 이끄는 팀은 개인 인간의 게놈 중 하나, 즉 Venter 자신의 DNA 수열을 발표했다. Venter의 게놈의 일부 수열은 젖은 귀지, 반사회적 행동의 증가된 위험, Alzheimer's 및 심혈관 질환과 연관되어 있다. 이 발표는 두 개의 대립유전자(각 염색체의 두 복사본)를 분리하려고 시도했기 때문에 특히 흥미로웠지만, 제한된 방식으로만 이를 달성했다. 발표된 게놈은 완전히 이배체 수열을 구성할 전체 60억 염기쌍이 아닌 30억 염기만 가지고 있었다. 첫 번째 대립유전자 해석 인간 게놈이 나타나기까지는 또 다른 10년이 지났다.

The Human Reference Genome Browser는 Venter의 최근에 발표된 게놈의 탐색 및 분석을 위한 웹 응용 프로그램이다. HuRef 데이터베이스는 약 32백만 개의 DNA 읽음으로 구성되어 있으며, 마이크로유체 Sanger 수열법을 사용하여 수열되었고, 4,528개의 스캐폴드로 조립되었으며, 게놈 분석으로 식별된 410만 개의 DNA 변이가 있다. 이러한 변이에는 single-nucleotide polymorphisms SNPs, 블록 치환, 짧은 및 큰 indels, 삽입, 삭제, 반전 및 복사 수 변화와 같은 구조적 변이가 포함된다.

브라우저는 과학자들이 HuRef 게놈 조립 및 수열 변이를 탐색하고 NCBI human build 36 조립과 NCBI 및 Ensembl 주석의 맥락에서 비교할 수 있게 한다. 브라우저는 NCBI와 HuRef 합의 수열, HuRef 조립의 수열 멀티 정렬, Ensembl 및 dbSNP 주석, HuRef 변이, 그리고 기본 변이 증거 및 기능 분석 사이의 비교 보기를 제공한다. 인터페이스는 또한 이배체 게놈 수열이 추론될 수 있는 단일잡종 블록과 유전자 주석에 대한 변이의 관계를 나타낸다. 변이 및 유전자 주석의 표시는 dbSNP, Ensembl, Online Mendelian Inheritance in Man OMIM 및 Gene Ontology GO를 포함한 외부 공개 자원에 연결되어 있다.

사용자는 HUGO 유전자 이름, Ensembl 및 dbSNP 식별자, HuRef contig 또는 스캐폴드 위치, 또는 NCBI 염색체 위치를 사용하여 HuRef 게놈을 검색할 수 있다. 사용자는 그 다음 간단하고 직관적인 팬 및 줌 컨트롤을 통해 모든 게놈 영역을 쉽고 빠르게 탐색할 수 있으며, 더욱이 특정 위치와 관련된 데이터를 추가 분석을 위해 내보낼 수 있다.

Human Longevity, Inc.

2014년 3월 4일 Venter와 공동 설립자 Peter Diamandis 그리고 Robert Hariri는 인간 수명 연장에 건강하고 "고성능" 인간 수명을 연장하는 데 중점을 두는 Human Longevity, Inc.의 형성을 발표했다. 발표 당시 회사는 이미 벤처 자금 7천만 달러를 모금했으며, 이는 18개월 동안 지속될 것으로 예상되었다. Venter는 2018년 5월까지 회장 및 최고경영자 CEO로 재직했으며, 그 때 물러났다. 회사는 연간 40,000개의 게놈을 수열하고, 초기에는 암 게놈 및 암 환자의 게놈에 중점을 두기를 계획했다고 말했다.

Human Longevity는 2018년 Venter를 상대로 소송을 제기했으며, 영업 비밀 도용으로 고소했다. Venter가 경쟁 사업을 시작하는 데 사용할 수 있는 귀중한 정보를 포함한 회사 컴퓨터를 가지고 떠났다는 주장이 제기되었다. 소송은 궁극적으로 California Judge에 의해 기각되었으며, Human Longevity가 회사 또는 개인이 영업 비밀이 도용되었을 때 소송할 수 있는 법적 기준을 충족하는 사건을 제시할 수 없다는 근거였다.

Human Longevity의 사명은 게놈학, 대사체학, 미생물 유전체학 및 단백질체학의 고해상도 빅 데이터 진단과 줄기 세포 치료의 사용을 통해 건강한 인간 수명을 연장하는 것이다.

출판된 책

Venter는 두 권의 책의 저자이며, 첫 번째 책은 A Life Decoded라는 제목의 자서전이었다. Venter의 두 번째 책은 Life at the Speed of Light라는 제목이었으며, 컴퓨터 프로그래밍과 DNA 수열법으로 인한 생명의 유전적 프로그래밍으로 나타나는 두 개의 이전에 다양한 과학 분야의 조화가 이 세대에 있다는 그의 이론을 발표했다. 그는 미래학자 Ray Kurzweil에 의해 이 입장에 대해 박수를 받았다.

개인적 삶

아들 Christopher를 낳은 Barbara Rae-Venter와의 짧은 결혼 후, 그는 Claire M. Fraser와 결혼했으며 2005년까지 그녀와 결혼 생활을 유지했다. 2008년 말 그는 Heather Kowalski와 결혼했다. 그들은 CA의 San Diego의 La Jolla 지역에 살고 있다. Venter는 무신론자이다.

Venter는 청소년