La vida es un sistema de software de ADN.
John Craig Venter es un biotecnólogo y empresario estadounidense. Es conocido por liderar el primer borrador de la secuencia del genoma humano y por ensamblar el primer equipo en transfectar una célula con un cromosoma sintético. Venter fundó Celera Genomics, The Institute for Genomic Research TIGR y el J. Craig Venter Institute JCVI, donde actualmente se desempeña como CEO. Fue cofundador de Human Longevity Inc. y Synthetic Genomics. Fue incluido en la lista Time 100 de la revista Time en 2007 y 2008 de las personas más influyentes del mundo. En 2010, la revista británica New Statesman incluyó a Craig Venter en el puesto 14 de la lista "The World's 50 Most Influential Figures 2010". En 2012, Venter fue honrado con el Dan David Prize por su contribución a la investigación del genoma. Es miembro de la Junta Asesora del USA Science and Engineering Festival.
Primeros años y educación
Venter nació en Salt Lake City, Utah, hijo de Elizabeth y John Venter. En su juventud, no tomó su educación en serio, prefiriendo pasar su tiempo en el agua en botes o navegando. Según su biografía, A Life Decoded, se decía que nunca fue un estudiante muy dedicado, teniendo C y D en sus calificaciones de octavo grado. Se graduó de Mills High School en Millbrae, California.
Aunque se opuso a la Guerra de Vietnam, Venter fue reclutado y se alistó en la Marina de los Estados Unidos donde trabajó en la sala de cuidados intensivos de un hospital de campaña. Mientras estaba en Vietnam, intentó suicidarse nadando hacia el mar, pero cambió de opinión a más de una milla de distancia. Estar confrontado con marines gravemente heridos y muriendo diariamente instó en él el deseo de estudiar medicina, aunque más tarde cambió a investigación biomédica.
Venter comenzó su educación universitaria en un colegio comunitario, College of San Mateo en California, y luego se trasladó a la University of California, San Diego, donde estudió bajo la dirección del bioquímico Nathan O. Kaplan. Recibió una licenciatura en bioquímica en 1972 y un doctorado en fisiología y farmacología en 1975 de UCSD.
Carrera
Después de trabajar como profesor asociado, y luego como profesor titular, en la State University of New York at Buffalo, se unió a los National Institutes of Health en 1984.
Controversia de EST
Mientras era empleado de los NIH, Venter aprendió a identificar mRNA y comenzó a aprender más sobre los expresados en el cerebro humano. Los fragmentos cortos de secuencia de cDNA en los que estaba interesado se llaman etiquetas de secuencia expresada, o EST. La Oficina de Transferencia de Tecnología de los NIH y Venter decidieron tomar los EST descubiertos por otros en un intento de patentar los genes identificados basándose en estudios de expresión de mRNA en el cerebro humano. Cuando Venter divulgó esta estrategia durante una audiencia del Congreso, estalló una tormenta de controversia. Los NIH posteriormente detuvieron el esfuerzo y abandonaron las solicitudes de patente que había presentado, siguiendo el clamor público.
Proyecto del Genoma Humano
Venter era apasionado por el poder de la genómica para transformar radicalmente la atención médica. Venter creía que la secuenciación escopeta era la forma más rápida y efectiva de obtener datos útiles del genoma humano. Sin embargo, el método fue rechazado por el Proyecto del Genoma Humano, ya que algunos genetistas sintieron que no sería lo suficientemente preciso para un genoma tan complicado como el de los humanos, que sería logísticamente más difícil, y que costaría significativamente más.
Venter vio el lento progreso en el proyecto del Genoma Humano como una oportunidad para continuar con su interés en patentar genes, por lo que buscó financiamiento del sector privado para iniciar Celera Genomics. La empresa planeaba beneficiarse de su trabajo creando datos genómicos a los que los usuarios pudieran suscribirse por una tarifa. El objetivo en consecuencia ejerció presión sobre el programa de genoma público e impulsó a varios grupos a reddoblar sus esfuerzos para producir la secuencia completa. El esfuerzo de Venter le ganó renombre ya que él y su equipo en Celera Corporation compartieron el crédito por secuenciar el primer borrador del genoma humano con el Proyecto del Genoma Humano financiado públicamente.
En 2000, Venter y Francis Collins de los National Institutes of Health y el U.S. Public Genome Project hicieron conjuntamente el anuncio del mapeo del genoma humano, tres años completos antes del final esperado del Programa del Genoma Público. El anuncio se hizo junto con el Presidente de los EE.UU. Bill Clinton y el Primer Ministro del Reino Unido Tony Blair. Venter y Collins así compartieron un premio por "Biografía del Año" de la Red A&E. El 15 de febrero de 2001, el consorcio del Proyecto del Genoma Humano publicó el primer Genoma Humano en la revista Nature, y fue seguido, un día después, por una publicación de Celera en Science. A pesar de algunas afirmaciones de que la secuenciación escopeta era en algunos sentidos menos precisa que el método clon por clon elegido por el Proyecto del Genoma Humano, la técnica fue ampliamente aceptada por la comunidad científica.
Venter fue despedido por Celera a principios de 2002. Según su biografía, Venter fue despedido debido a un conflicto con el principal inversor, Tony White, específicamente impidiéndole asistir a la ceremonia de la Casa Blanca celebrando el logro de la secuenciación del genoma humano.
Expedición Global de Muestreo Oceánico
La Expedición Global de Muestreo Oceánico GOS es un proyecto de exploración y genómica oceánica con el objetivo de evaluar la diversidad genética en comunidades microbianas marinas y comprender su papel en los procesos fundamentales de la naturaleza. Comenzado como un proyecto piloto de muestreo del Mar de los Sargazos en agosto de 2003, Venter anunció la Expedición completa el 4 de marzo de 2004. El proyecto, que utilizó el yate personal de Venter, Sorcerer II, comenzó en Halifax, Canadá, circunnavegó el globo y regresó a los EE.UU. en enero de 2006.
Genómica Sintética
En junio de 2005, Venter cofundó Synthetic Genomics, una empresa dedicada a usar microorganismos modificados para producir combustibles limpios y productos químicos. En julio de 2009, ExxonMobil anunció una colaboración de 600 millones de dólares con Synthetic Genomics para investigar y desarrollar biocombustibles de próxima generación. Venter continúa trabajando en la creación de microalgas diatómicas modificadas para la producción de biocombustibles.
Venter está buscando patentar la primera especie parcialmente sintética, posiblemente se le nombre Mycoplasma laboratorium. Hay especulación de que esta línea de investigación podría llevar a la producción de bacterias que han sido modificadas genéticamente para realizar reacciones específicas, por ejemplo, producir combustibles, hacer medicinas, combatir el calentamiento global, etcétera.
En mayo de 2010, un equipo de científicos dirigido por Venter se convirtió en el primero en crear exitosamente lo que fue descrito como "vida sintética". Esto se hizo sintetizando una molécula de ADN muy larga que contiene un genoma bacteriano completo e introduciéndola en otra célula, análogo al logro del grupo de Eckard Wimmer, quienes sintetizaron y ligaron un genoma de virus de ARN y lo "iniciaron" en lisado celular. El organismo unicelular contiene cuatro "marcas de agua" escritas en su ADN para identificarlo como sintético y para ayudar a rastrear sus descendientes. Las marcas de agua incluyen
- Tabla de código para alfabeto completo con puntuaciones
- Nombres de 46 científicos contribuyentes
- Tres citas
- La dirección de correo electrónico secreta de la célula.
El 25 de marzo de 2016, Venter informó la creación de Syn 3.0, un genoma sintético con el menor número de genes de cualquier organismo de vida libre 473 genes. Su objetivo era eliminar todos los genes no esenciales, dejando solo el conjunto mínimo necesario para sustentar la vida. Se espera que esta célula de rápida reproducción y simplificada sea una herramienta valiosa para investigadores en el campo.
En agosto de 2018, Venter se retiró como presidente de la junta, diciendo que quería enfocarse en su trabajo en el J. Craig Venter Institute. Se mantendrá como asesor científico de la junta.
J. Craig Venter Institute
Venter es actualmente el director ejecutivo del J. Craig Venter Institute, una organización sin fines de lucro que realiza investigaciones en biología sintética. Venter fundó la organización en 2006. Tiene instalaciones en La Jolla y en Rockville, Maryland y emplea a más de 200 personas.
Genoma humano individual
El 4 de septiembre de 2007, un equipo dirigido por Sam Levy publicó uno de los primeros genomas de un humano individual—la propia secuencia de ADN de Venter. Algunas de las secuencias en el genoma de Venter están asociadas con cerumen húmedo, mayor riesgo de comportamiento antisocial, Alzheimer y enfermedades cardiovasculares. Esta publicación fue especialmente interesante porque intentó separar los dos haplotipos las dos copias de cada cromosoma, aunque solo logró esto de manera limitada. El genoma como se publicó solo tenía 3 mil millones de bases, en lugar de los 6 mil millones completos que comprenderían una secuencia completamente diploide. Pasaron otros 10 años antes de que comenzaran a aparecer los primeros genomas humanos resueltos en haplotipos.
El Human Reference Genome Browser es una aplicación web para la navegación y análisis del genoma recientemente publicado de Venter. La base de datos HuRef consiste en aproximadamente 32 millones de lecturas de ADN secuenciadas usando secuenciación Sanger de microfluidica, ensambladas en 4,528 scaffolds y 4.1 millones de variaciones de ADN identificadas por análisis genómico. Estas variantes incluyen polimorfismos de un solo nucleótido SNP, sustituciones en bloque, indels cortos y grandes, y variaciones estructurales como inserciones, deleciones, inversiones y cambios en número de copias.
El navegador permite a los científicos navegar por el ensamblaje del genoma HuRef y variaciones de secuencia, y compararlo con el ensamblaje NCBI human build 36 en el contexto de las anotaciones NCBI y Ensembl. El navegador proporciona una vista comparativa entre secuencias de consenso NCBI y HuRef, el múltiple alineamiento de secuencias del ensamblaje HuRef, anotaciones de Ensembl y dbSNP, variantes HuRef, y la evidencia de variante subyacente y análisis funcional. La interfaz también representa los bloques de haplotipos a partir de los cuales se puede inferir la secuencia del genoma diploide y la relación de las variantes con las anotaciones de genes. La visualización de variantes y anotaciones de genes se vinculan a recursos públicos externos incluyendo dbSNP, Ensembl, Online Mendelian Inheritance in Man OMIM y Gene Ontology GO.
Los usuarios pueden buscar el genoma HuRef usando nombres de genes HUGO, identificadores de Ensembl y dbSNP, ubicaciones de contig o scaffold de HuRef, o ubicaciones de cromosoma NCBI. Los usuarios entonces pueden fácil y rápidamente navegar cualquier región genómica mediante los controles simples e intuitivos de paneo y zoom; además, los datos relevantes para loci específicos pueden exportarse para análisis adicional.
Human Longevity, Inc.
El 4 de marzo de 2014, Venter y los cofundadores Peter Diamandis y Robert Hariri anunciaron la formación de Human Longevity, Inc., una empresa enfocada en extender la vida humana saludable, "de alto rendimiento". En el momento del anuncio, la empresa ya había recaudado 70 millones de dólares en financiamiento de inversión de riesgo, que se esperaba durara 18 meses. Venter se desempeñó como presidente y director ejecutivo CEO hasta mayo de 2018, cuando se retiró. La empresa dijo que planea secuenciar 40,000 genomas por año, con un enfoque inicial en genomas de cáncer y genomas de pacientes con cáncer.
Human Longevity presentó una demanda en 2018 contra Venter, acusándolo de robar secretos comerciales. Se hicieron alegaciones que afirmaban que Venter se había ido con la computadora de su empresa que contenía información valiosa que podría usarse para iniciar un negocio competidor. La demanda fue finalmente desestimada por un Juez de California sobre la base de que Human Longevity no pudo presentar un caso que cumpliera con el umbral legal requerido para que una empresa o individuo demandara cuando sus secretos comerciales han sido robados.
La misión de Human Longevity es extender la vida humana saludable mediante el uso de diagnósticos de datos grandes de alta resolución de genómica, metabolómica, microbiómica y proteómica, y el uso de terapia con células madre.
Libros publicados
Venter es el autor de dos libros, el primero de los cuales fue una autobiografía titulada A Life Decoded. El segundo libro de Venter fue titulado Life at the Speed of Light en el que anunció su teoría de que esta es la generación en la que parece haber un acoplamiento de los dos campos de la ciencia previamente diversos representados por la programación de computadoras y la programación genética de la vida por secuenciación de ADN. Fue aplaudido por su posición en esto por el futurólogo Ray Kurzweil.
Vida personal
Después de un breve matrimonio con Barbara Rae-Venter, con quien tuvo un hijo, Christopher, se casó con Claire M. Fraser permaneciendo casado con ella hasta 2005. A finales de 2008 se casó con Heather Kowalski. Viven en el vecindario de La Jolla de San Diego, CA. Venter es ateo.
Venter consideraba que su comportamiento en su adolescencia era indicativo del trastorno por déficit de atención con hiperactividad TDAH, y posteriormente encontró variantes genéticas asociadas con TDAH en su propio ADN.
En la cultura popular
Venter ha sido objeto de artículos en varias revistas, incluyendo Wired, The Economist, la revista científica australiana Cosmos, y The Atlantic.
Venter aparece en el especial NOVA de dos horas de 2001, "Cracking the code of life".
El 16 de mayo de 2004, Venter dio el discurso de graduación en Boston University.
El 4 de diciembre de 2007, Venter dio la conferencia Dimbleby para la BBC en Londres.
Venter impartió el discurso de convocatoria 2008 para estudiantes de honores y especialización de la Facultad de Ciencias en la University of Alber
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