生命是一个DNA软件系统。
John Craig Venter是一位美国生物技术专家和商人。他因领导人类基因组的第一份草图序列而闻名,并组建了第一支用合成染色体转染细胞的团队。Venter创立了Celera Genomics、基因组研究所TIGR和J. Craig Venter Institute JCVI,目前担任首席执行官。他是Human Longevity Inc.和Synthetic Genomics的联合创始人。他被列入《时代》杂志2007年和2008年全球最具影响力人物100人名单。2010年,英国杂志《新政治家》在"2010年世界50位最具影响力人物"名单中将Craig Venter列为第14位。2012年,Venter因其对基因组研究的贡献获得Dan David奖。他是美国科学与工程节目咨询委员会的成员。
早年生活和教育
Venter出生于美国犹他州盐湖城,父母是Elizabeth和John Venter。在他的青少年时期,他不太重视教育,更喜欢在水上划船或冲浪。根据他的传记《A Life Decoded》,据说他从未是一个非常投入的学生,八年级时成绩单上都是C和D。他毕业于加州Millbrae的Mills High School。
虽然他反对越南战争,但Venter被征募并加入美国海军,在一家野战医院的重症监护病房工作。在越南期间,他试图通过游向大海自杀,但在游出一英里多后改变了主意。每天都与重伤和垂死的海军陆战队员接触,激发了他学习医学的欲望,尽管他后来转向生物医学研究。
Venter开始在加州社区学院San Mateo学院接受大学教育,后来转入加州大学圣地亚哥分校,在生化学家Nathan O. Kaplan的指导下学习。他于1972年获得生化学学士学位,1975年从UCSD获得生理学和药理学博士学位。
职业生涯
在纽约州立大学布法罗分校担任副教授,后来担任正教授后,他于1984年加入美国国家卫生研究院。
EST争议
在美国国家卫生研究院工作期间,Venter学会了如何识别mRNA,并开始了解更多关于在人脑中表达的mRNA。他感兴趣的短cDNA序列片段被称为表达序列标签或EST。美国国家卫生研究院技术转移办公室和Venter决定采用他人发现的EST,试图对基于人脑mRNA表达研究所确定的基因进行专利申请。当Venter在国会听证会上披露这一策略时,引发了一场激烈的争议。美国国家卫生研究院随后停止了这一努力,并在公众的强烈反对下放弃了它所提交的专利申请。
人类基因组计划
Venter对基因组学的力量充满热情,相信它能从根本上改变医疗保健。Venter认为猎枪测序是获取有用人类基因组数据的最快和最有效的方法。然而,人类基因组计划拒绝了这种方法,因为一些遗传学家认为它的准确性不足以处理像人类这样复杂的基因组,从后勤角度来说会更加困难,并且成本会显著增加。
Venter将人类基因组项目进展缓慢视为继续他对基因专利化感兴趣的机会,因此他从私营部门寻求资金来创建Celera Genomics。该公司计划通过创建用户可以付费订阅的基因组数据来从工作中获利。这个目标给公共基因组计划施加了压力,并促使多个小组加倍努力以生成完整序列。Venter的努力为他赢得了声誉,他和Celera Corporation的团队与公共资助的人类基因组计划共同分享了测序第一份人类基因组草图的荣誉。
2000年,Venter和美国国家卫生研究院的Francis Collins以及美国公共基因组计划联合宣布了人类基因组的绘制,比公共基因组计划的预期结束时间提前了整整三年。宣布与美国总统Bill Clinton和英国首相Tony Blair一起进行。Venter和Collins因此获得了来自A&E Network的"年度传记"奖。2001年2月15日,人类基因组计划联盟在《自然》杂志上发表了第一个人类基因组,随后一天后,Celera在《科学》杂志上发表了论文。尽管有一些声称猎枪测序在某些方面不如人类基因组计划选择的分步克隆方法准确,但该技术被科学界广泛接受。
Venter在2002年初被Celera开除。根据他的传记,Venter被开除是由于与主要投资者Tony White发生冲突,特别是禁止他参加庆祝人类基因组测序成就的白宫仪式。
全球海洋采样探险
全球海洋采样探险GOS是一个海洋探险基因组项目,目标是评估海洋微生物群落的遗传多样性,并了解它们在自然基本过程中的作用。作为2003年8月开始的Sargasso Sea试点采样项目,Venter在2004年3月4日宣布了完整的探险活动。该项目使用Venter个人的游艇Sorcerer II,从加拿大Halifax开始,环球航行,并于2006年1月返回美国。
合成基因组学
2005年6月,Venter联合创立了Synthetic Genomics,这是一家致力于使用改良微生物来生产清洁燃料和生化物质的公司。2009年7月,ExxonMobil宣布与Synthetic Genomics达成6亿美元的合作协议,以研究和开发下一代生物燃料。Venter继续从事工程设计双原子微藻用于生物燃料生产的工作。
Venter试图对第一个可能被命名为Mycoplasma laboratorium的部分合成物种进行专利申请。有人推测这条研究路线可能导致生产已被设计成执行特定反应的细菌,例如生产燃料、制造药物、应对全球变暖等。

2010年5月,由Venter领导的科学家团队成为第一个成功创造被描述为"合成生命"的团队。这是通过合成包含整个细菌基因组的非常长的DNA分子,并将其引入另一个细胞来完成的,类似于Eckard Wimmer的小组的成就,他们合成并连接了RNA病毒基因组并在细胞裂解液中"启动"了它。这个单细胞生物体的DNA中包含四个"水印",用以识别其为合成的并帮助追踪其后代。水印包括
- 整个字母表及标点符号的代码表
- 46名贡献科学家的名字
- 三条引用
- 该细胞的秘密电子邮件地址
2016年3月25日,Venter报告了Syn 3.0的创建,这是一个具有任何自由生活生物体最少基因数(473个基因)的合成基因组。他们的目标是剥离所有非必需基因,只保留支持生命所必需的最少基因集。这个精简的快速繁殖细胞预期将成为该领域研究人员的宝贵工具。
2018年8月,Venter从董事会主席的职位上退休,称他希望专注于他在J. Craig Venter Institute的工作。他将继续担任董事会的科学顾问。
J. Craig Venter Institute
Venter目前是J. Craig Venter Institute的首席执行官,该机构是一个从事合成生物学研究的非营利组织。Venter于2006年创立了该组织。它在La Jolla和马里兰州Rockville设有办公室,员工超过200人。
个人人类基因组
2007年9月4日,由Sam Levy领导的团队发表了第一批个人人类基因组之一——Venter自己的DNA序列。Venter基因组中的一些序列与湿性耳垢、反社会行为风险增加、阿尔茨海默病和心血管疾病有关。这个发表特别有趣,因为它试图分离两个单倍体——每条染色体的两个副本,尽管它只在有限的范围内完成了这一点。已发表的基因组只有30亿个碱基,而不是组成完全二倍体序列的全部60亿个。又过了10年,第一个单倍体解析的人类基因组才开始出现。
人类参考基因组浏览器是一个用于导航和分析Venter最近发布的基因组的网络应用程序。HuRef数据库包含大约3200万个DNA读数,使用微流体Sanger测序进行测序,组装成4,528个支架,并通过基因组分析确定了410万个DNA变异。这些变异包括单核苷酸多态性SNP、块替换、短和大型插入缺失,以及结构变异如插入、缺失、倒位和拷贝数变化。
该浏览器使科学家能够浏览HuRef基因组组装和序列变异,并在NCBI和Ensembl注释的背景下将其与NCBI人类构建36组装进行比较。浏览器提供了NCBI和HuRef共识序列之间的比较视图、HuRef组装的序列多重比对、Ensembl和dbSNP注释、HuRef变异以及基础变异证据和功能分析。该界面还表示可以从中推断出二倍体基因组序列的单倍体块以及变异与基因注释的关系。变异和基因注释的显示链接到外部公共资源,包括dbSNP、Ensembl、在线孟德尔遗传OMIM和基因本体论GO。
用户可以使用HUGO基因名称、Ensembl和dbSNP标识符、HuRef contig或支架位置或NCBI染色体位置来搜索HuRef基因组。用户随后可以轻松快速地通过简单直观的平移和缩放控件浏览任何基因组区域;此外,与特定位点相关的数据可以导出以进行进一步分析。
Human Longevity, Inc.
2014年3月4日,Venter和联合创始人Peter Diamandis及Robert Hariri宣布成立Human Longevity, Inc.,这是一家致力于延长健康的"高性能"人类寿命的公司。在宣布时,该公司已经筹集了7000万美元的风险融资,预期可维持18个月。Venter担任主席和首席执行官,直到2018年5月退休。该公司表示计划每年测序40,000个基因组,初期重点关注癌症基因组和癌症患者的基因组。
Human Longevity在2018年对Venter提起诉讼,指控他窃取商业机密。指控声称Venter携带他的公司计算机离职,该计算机包含可用于开展竞争业务的宝贵信息。该诉讼最终被加州法官驳回,理由是Human Longevity无法提出符合公司或个人在商业机密被盗时提起诉讼所需法律门槛的案例。
Human Longevity的使命是通过使用来自基因组学、代谢组学、微生物组学和蛋白质组学的高分辨率大数据诊断以及干细胞疗法的使用来延长健康的人类寿命。
已出版的书籍
Venter是两部书的作者,其中第一部是一部名为《A Life Decoded》的自传。Venter的第二部书名为《生命的光速》,其中他宣布了他的理论,即这是出现了两个以前不同科学领域——计算机编程和DNA测序代表的生命遗传编程的契合的一代。未来主义者Ray Kurzweil为他的这一立场而鼓掌。
个人生活
在与Barbara Rae-Venter的短暂婚姻之后,他与她生有一个儿子Christopher,他后来与Claire M. Fraser结婚,两人一直保持婚姻关系直到2005年。2008年末,他与Heather Kowalski结婚。他们住在加州圣地亚哥的La Jolla社区。Venter是无神论者。
Venter认为他青春期时的行为表现是注意力缺陷多动障碍ADHD的指标,并在他自己的DNA中发现了与ADHD相关的遗传变异。
在流行文化中
Venter一直是多家杂志文章的主题,包括《连线》、《经济学人》、澳大利亚科学杂志《Cosmos》和《大西洋月刊》。
Venter出现在2001年两小时的NOVA特别节目《破译生命密码》中。
2004年5月16日,Venter在波士顿大学做了毕业致辞。
2007年12月4日,Venter在伦敦为BBC做了Dimbleby演讲。
Venter在2008年为Alber大学科学学院荣誉和专业学生做了始业演讲


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