Craig Venter

الحياة هي نظام برمجيات DNA.

جون كريج فينتر هو عالم تكنولوجيا حيوية ورجل أعمال أمريكي. وهو معروف بقيادته للمسودة الأولى لتسلسل الجينوم البشري وتجميعه لأول فريق يقوم بنقل كروموسوم اصطناعي إلى خلية. أسس فينتر شركة Celera Genomics والمعهد الوطني لأبحاث الجينوم TIGR ومعهد J. Craig Venter Institute JCVI، حيث يعمل حالياً كرئيس تنفيذي. كان المؤسس المشارك لـ Human Longevity Inc. و Synthetic Genomics. تم إدراجه في قائمة Time 100 لمجلة Time عامي 2007 و2008 الخاصة بأكثر الشخصيات تأثيراً في العالم. في عام 2010، أدرجت مجلة New Statesman البريطانية كريج فينتر في المركز الرابع عشر في قائمة "أكثر 50 شخصية مؤثرة في العالم 2010". في عام 2012، تم تكريم فينتر بجائزة Dan David لمساهمته في أبحاث الجينوم. وهو عضو في مجلس الاستشارين في مهرجان العلوم والهندسة الأمريكي.

الحياة المبكرة والتعليم

وُلد فينتر في مدينة Salt Lake City بولاية Utah، وهو ابن Elizabeth و John Venter. في شبابه، لم يأخذ تعليمه بجدية، فضلاً على قضاء وقته على الماء في القوارب أو ممارسة رياضة ركوب الأمواج. وفقاً لسيرته الذاتية A Life Decoded، يُقال إنه لم يكن طالباً منخرطاً بشكل كبير، حيث حصل على درجات C و D في بطاقات التقارير الخاصة به في الصف الثامن. تخرج من Mills High School في Millbrae بولاية California.

على الرغم من معارضته لحرب فيتنام، تم تجنيد فينتر والتحق بالبحرية الأمريكية حيث عمل في قسم العناية المكثفة بمستشفى ميداني. أثناء وجوده في فيتنام، حاول الانتحار بالسباحة نحو البحر، لكنه غيّر رأيه على بعد أكثر من ميل واحد. كان تعرضه اليومي لجنود مشاة البحرية المصابين بجروح خطيرة والمحتضرين مصدر إلهام له لدراسة الطب، على الرغم من أنه تحول لاحقاً إلى أبحاث الهندسة الحيوية.

بدأ فينتر تعليمه الجامعي في كلية مجتمع، College of San Mateo في California، وانتقل لاحقاً إلى جامعة California, San Diego، حيث درس تحت إشراف الكيميائي الحيوي Nathan O. Kaplan. حصل على درجة البكالوريوس في الكيمياء الحيوية عام 1972 ودرجة الدكتوراه في علم الفسيولوجيا والصيدلة عام 1975 من UCSD.

المسيرة المهنية

بعد عمله أستاذاً مساعداً، ثم أستاذاً كاملاً، في جامعة State University of New York at Buffalo، انضم إلى المعاهد الوطنية للصحة عام 1984.

جدل EST

عندما كان موظفاً في NIH، تعلم فينتر كيفية تحديد mRNA وبدأ في تعلم المزيد حول تلك المعبرة في الدماغ البشري. شظايا تسلسل cDNA القصيرة التي كان مهتماً بها تسمى بطاقات تسلسل معبرة، أو ESTs. قررت مكتب نقل التكنولوجيا بـ NIH وفينتر أن يأخذوا ESTs التي اكتشفها آخرون في محاولة لتسجيل براءة اختراع للجينات المحددة بناءً على دراسات التعبير عن mRNA في الدماغ البشري. عندما كشف فينتر عن هذه الاستراتيجية خلال جلسة استماع في الكونجرس، اندلعت عاصفة من الجدل. توقفت NIH لاحقاً عن المحاولة وتخلت عن طلبات براءات الاختراع التي قدمتها، بعد الضغط الشعبي.

مشروع الجينوم البشري

كان فينتر متحمساً لقوة الجينوميات في تحويل الرعاية الصحية بشكل جذري. آمن فينتر بأن تسلسل الرش كان الطريقة الأسرع والأكثر فعالية للحصول على بيانات جينوم بشري مفيدة. ورفض المشروع الدولي للجينوم البشري هذه الطريقة، إلا أن بعض علماء الوراثة شعروا بأنها لن تكون دقيقة بما فيه الكفاية لجينوم معقد مثل جينوم الإنسان، وأنها ستكون أكثر صعوبة لوجستياً، وأنها ستكلف أكثر بكثير.

اعتبر فينتر الوتيرة البطيئة للتقدم في مشروع الجينوم البشري بمثابة فرصة للمتابعة اهتمامه برسم براءات الاختراع للجينات، لذا سعى للحصول على التمويل من القطاع الخاص لتأسيس Celera Genomics. كانت الشركة تخطط للربح من عملهم من خلال إنشاء بيانات جينومية يمكن للمستخدمين الاشتراك فيها مقابل رسوم. وقد أدى هذا الهدف إلى الضغط على برنامج الجينوم العام وحفّز عدة مجموعات على مضاعفة جهودها لإنتاج التسلسل الكامل. فاز جهد فينتر بسمعة جيدة حيث شاركت هو وفريقه في Celera Corporation الفضل في تسلسل مسودة الجينوم البشري الأول مع مشروع الجينوم البشري الممول من القطاع العام.

في عام 2000، أعلن فينتر و Francis Collins من المعاهد الوطنية للصحة ومشروع الجينوم العام الأمريكي معاً عن رسم خريطة الجينوم البشري، قبل ثلاث سنوات كاملة من نهاية برنامج الجينوم العام المتوقعة. تم الإعلان مع الرئيس الأمريكي Bill Clinton ورئيس الوزراء البريطاني Tony Blair. شارك فينتر و Collins بالتالي في جائزة "السيرة الذاتية للسنة" من شبكة A&E. في 15 فبراير 2001، نشر اتحاد مشروع الجينوم البشري أول جينوم بشري في مجلة Nature، وتبعه نشر Celera بعد يوم واحد في مجلة Science. على الرغم من بعض المزاعم بأن تسلسل الرش كان أقل دقة من طريقة الاستنساخ بالاستنساخ التي اختارها مشروع الجينوم البشري، أصبحت التقنية مقبولة على نطاق واسع من قبل المجتمع العلمي.

تم فصل فينتر من Celera في أوائل عام 2002. وفقاً لسيرته الذاتية، تم فصل فينتر بسبب نزاع مع المستثمر الرئيسي، Tony White، وتحديداً منعه من حضور حفل البيت الأبيض الذي يحتفل بإنجاز تسلسل الجينوم البشري.

حملة أخذ العينات من المحيط العالمي

حملة Global Ocean Sampling Expedition GOS هي مشروع استكشاف محيطي جينومي بهدف تقييم التنوع الجيني في المجتمعات الميكروبية البحرية وفهم دورها في العمليات الأساسية في الطبيعة. بدأت كمشروع عينة تجريبي في بحر Sargasso في أغسطس 2003، أعلن فينتر عن الحملة الكاملة في 4 مارس 2004. استخدم المشروع يخت فينتر الخاص، Sorcerer II، وبدأ في Halifax بكندا، وحاصر الكرة الأرضية وعاد إلى الولايات المتحدة في يناير 2006.

الجينوميات الاصطناعية

في يونيو 2005، أسس فينتر بشكل مشترك Synthetic Genomics، وهي شركة مكرسة لاستخدام الكائنات الحية الدقيقة المعدلة لإنتاج الوقود النظيف والمواد الكيميائية. في يوليو 2009، أعلنت ExxonMobil عن تعاون بقيمة 600 مليون دولار مع Synthetic Genomics للبحث والتطوير في المحاقن الحيوية من الجيل التالي. يواصل فينتر العمل على إنشاء الطحالب الدقيقة ثنائية الذرات الهندسية لإنتاج الوقود الحيوي.

يسعى فينتر لتسجيل براءة اختراع لأول نوع اصطناعي جزئياً ربما يُطلق عليه اسم Mycoplasma laboratorium. هناك تخمينات بأن هذا النوع من الأبحاث يمكن أن يؤدي إلى إنتاج بكتيريا تم هندستها لتنفيذ تفاعلات محددة، على سبيل المثال، إنتاج الوقود، صنع الأدوية، مكافحة الاحتباس الحراري العالمي، وما إلى ذلك.

في مايو 2010، أصبح فريق من العلماء بقيادة فينتر أول من نجح في إنشاء ما وصف بـ "الحياة الاصطناعية". تم ذلك من خلال تصنيع جزيء DNA طويل جداً يحتوي على جينوم بكتيري كامل، وإدخاله في خلية أخرى، مماثلة لإنجاز فريق Eckard Wimmer، الذين قاموا بتصنيع وربط جينوم فيروس RNA و"إطلاقه" في محلول الخلايا. يحتوي الكائن أحادي الخلية على أربع "علامات مائية" مكتوبة في حمضها النووي لتحديده كمصطنع ولمساعدة في تتبع نسله. تتضمن العلامات المائية

1. جدول الأكواد للأبجدية كاملة مع الترقيم
2. أسماء 46 عالماً مساهماً
3. ثلاث اقتباسات
4. عنوان البريد الإلكتروني السري للخلية.

في 25 مارس 2016، أبلغ فينتر عن إنشاء Syn 3.0، جينوم اصطناعي يحتوي على أقل عدد من الجينات لأي كائن حي حر 473 جين. كانت هدفهم تجريد جميع الجينات غير الأساسية، تاركين فقط الحد الأدنى اللازم لدعم الحياة. من المتوقع أن تكون هذه الخلية المجردة سريعة التكاثر أداة قيمة للباحثين في هذا المجال.

في أغسطس 2018، تقاعد فينتر كرئيس مجلس الإدارة، قائلاً إنه يريد التركيز على عمله في معهد J. Craig Venter Institute. سيبقى مستشاراً علمياً لمجلس الإدارة.

معهد J. Craig Venter

فينتر هو حالياً الرئيس التنفيذي لمعهد J. Craig Venter Institute، وهو منظمة غير ربحية تجري أبحاثاً في الأحياء الاصطناعية. أسس فينتر المنظمة عام 2006. لها مرافق في La Jolla وفي Rockville بولاية Maryland وتوظف أكثر من 200 شخص.

الجينوم البشري الفردي

في 4 سبتمبر 2007، نشر فريق بقيادة Sam Levy أحد أول جينومات الإنسان الفردي - تسلسل الحمض النووي الخاص بفينتر. بعض التسلسلات في جينوم فينتر مرتبطة بشمع الأذن الرطب وزيادة خطر السلوك غير الاجتماعي والزهايمر وأمراض القلب والأوعية الدموية. كان هذا النشر مثيراً للاهتمام بشكل خاص لأنه حاول فصل الفئتين الهابلويتات النسختين من كل كروموسوم، على الرغم من أنه لم ينجح سوى بطريقة محدودة. احتوى الجينوم كما نُشر على 3 مليارات قاعدة فقط، بدلاً من 6 مليارات الكاملة التي ستشكل تسلسلاً ثنائي الصيغة الكاملة. مرّ ما يقرب من 10 سنوات أخرى قبل أن تبدأ أول جينومات بشرية محللة الهابلويتات في الظهور.

متصفح Human Reference Genome Browser هو تطبيق ويب للتنقل والتحليل في الجينوم المنشور مؤخراً لفينتر. تتكون قاعدة بيانات HuRef من حوالي 32 مليون قراءة DNA محسوسة باستخدام تسلسل Sanger الميكروسائل، مجمعة في 4528 scaffold و 4.1 مليون تباين DNA محددة بواسطة تحليل الجينوم. تتضمن هذه الاختلافات تعددات النيوكليوتيدات الفردية SNPs والاستبدالات الكتلية والإدراجات والحذف القصير والكبير والاختلافات الهيكلية مثل الإدراجات والحذف والانقلابات وتغييرات رقم النسخ.

يمكّن المتصفح العلماء من التنقل عبر تجميع جينوم HuRef وتباينات التسلسل، ومقارنتها مع تجميع NCBI human build 36 في سياق تعليقات NCBI و Ensembl. يوفر المتصفح عرضاً مقارناً بين تسلسلات NCBI و HuRef الإجماعية، والمحاذاة المتعددة للتسلسل في تجميع HuRef، وتعليقات Ensembl و dbSNP، وتباينات HuRef، والأدلة الأساسية والتحليل الوظيفي. تُرتبط العرض أيضاً بـ كتل الهابلويتات التي يمكن من خلالها استدلال تسلسل جينوم ثنائي الصيغة ويُظهر علاقة التباينات بتعليقات الجينات. يتم ربط عرض التباينات وتعليقات الجينات بموارد عامة خارجية بما في ذلك dbSNP و Ensembl و Online Mendelian Inheritance in Man OMIM و Gene Ontology GO.

يمكن للمستخدمين البحث في جينوم HuRef باستخدام أسماء جينات HUGO ومعرّفات Ensembl و dbSNP وموقع contig أو scaffold في HuRef أو مواقع كروموسوم NCBI. يمكن للمستخدمين بعد ذلك التنقل بسهولة وسرعة في أي منطقة جينومية من خلال عناصر التحكم البسيطة والحدسية؛ علاوة على ذلك، يمكن تصدير البيانات ذات الصلة بالمواقع المحددة للتحليل الإضافي.

Human Longevity, Inc.

في 4 مارس 2014، أعلن فينتر والمؤسسون المشاركون Peter Diamandis و Robert Hariri عن تشكيل Human Longevity, Inc.، وهي شركة تركز على توسيع متوسط العمر البشري الصحي "عالي الأداء". في وقت الإعلان، كانت الشركة قد جمعت بالفعل 70 مليون دولار في تمويل رأس المال الاستثماري، والذي كان متوقعاً أن يستمر 18 شهراً. عمل فينتر كرئيس والرئيس التنفيذي CEO حتى مايو 2018، عندما تقاعد. قالت الشركة إنها تخطط لتسلسل 40000 جينوم سنوياً، مع التركيز الأولي على جينومات السرطان وجينومات مرضى السرطان.

رفعت Human Longevity دعوى قضائية في 2018 ضد فينتر، متهمة إياه بسرقة أسرار